Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprmP28828 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtprmP28828 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprmP28828 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprmP28828 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprmP28828 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PtprmP28828 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
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