Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Etv4P28322 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Etv4P28322 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Etv4P28322 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Etv4P28322 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Etv4P28322 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Etv4P28322 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Etv4P28322 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Etv4P28322 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms