Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ChgaP26339 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChgaP26339 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgaP26339 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChgaP26339 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChgaP26339 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms