Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cd247P24161 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd247P24161 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd247P24161 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd247P24161 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms