Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkchP23298 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkchP23298 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkchP23298 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkchP23298 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkchP23298 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PrkchP23298 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PrkchP23298 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PrkchP23298 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PrkchP23298 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkchP23298 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkchP23298 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkchP23298 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkchP23298 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkchP23298 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkchP23298 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkchP23298 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkchP23298 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkchP23298 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkchP23298 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkchP23298 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkchP23298 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkchP23298 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkchP23298 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkchP23298 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkchP23298 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkchP23298 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkchP23298 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkchP23298 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkchP23298 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkchP23298 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkchP23298 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkchP23298 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkchP23298 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkchP23298 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkchP23298 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkchP23298 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkchP23298 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkchP23298 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkchP23298 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkchP23298 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkchP23298 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkchP23298 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkchP23298 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkchP23298 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PrkchP23298 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms