Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Eif3aP23116 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Eif3aP23116 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms