Protein–RNA interactions for Protein: P22907

Hmbs, Porphobilinogen deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmbsP22907 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmbsP22907 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmbsP22907 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HmbsP22907 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HmbsP22907 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmbsP22907 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HmbsP22907 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HmbsP22907 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms