Protein–RNA interactions for Protein: P21278

Gna11, Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gna11P21278 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gna11P21278 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gna11P21278 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gna11P21278 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gna11P21278 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gna11P21278 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gna11P21278 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gna11P21278 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gna11P21278 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gna11P21278 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gna11P21278 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms