Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TP20293 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TP20293 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TP20293 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TP20293 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TP20293 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TP20293 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TP20293 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TP20293 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TP20293 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TP20293 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TP20293 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TP20293 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TP20293 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TP20293 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TP20293 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TP20293 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TP20293 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TP20293 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TP20293 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TP20293 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TP20293 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TP20293 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TP20293 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TP20293 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TP20293 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TP20293 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TP20293 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TP20293 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TP20293 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TP20293 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TP20293 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TP20293 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TP20293 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TP20293 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TP20293 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TP20293 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TP20293 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TP20293 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TP20293 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TP20293 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TP20293 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TP20293 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TP20293 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TP20293 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TP20293 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TP20293 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TP20293 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TP20293 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TP20293 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TP20293 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TP20293 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TP20293 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TP20293 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TP20293 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TP20293 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TP20293 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TP20293 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TP20293 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TP20293 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TP20293 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TP20293 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TP20293 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TP20293 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TP20293 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TP20293 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TP20293 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TP20293 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TP20293 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TP20293 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TP20293 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TP20293 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TP20293 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TP20293 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TP20293 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TP20293 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TP20293 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TP20293 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TP20293 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TP20293 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TP20293 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TP20293 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TP20293 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TP20293 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TP20293 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TP20293 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TP20293 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TP20293 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TP20293 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TP20293 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TP20293 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TP20293 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TP20293 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TP20293 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TP20293 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TP20293 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TP20293 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TP20293 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TP20293 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TP20293 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms