Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NefhP19246 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NefhP19246 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NefhP19246 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NefhP19246 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NefhP19246 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NefhP19246 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NefhP19246 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NefhP19246 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NefhP19246 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NefhP19246 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NefhP19246 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NefhP19246 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NefhP19246 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NefhP19246 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NefhP19246 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NefhP19246 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NefhP19246 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NefhP19246 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NefhP19246 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NefhP19246 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NefhP19246 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NefhP19246 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NefhP19246 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NefhP19246 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NefhP19246 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NefhP19246 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NefhP19246 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NefhP19246 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NefhP19246 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NefhP19246 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NefhP19246 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NefhP19246 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NefhP19246 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NefhP19246 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NefhP19246 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NefhP19246 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NefhP19246 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NefhP19246 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NefhP19246 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NefhP19246 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NefhP19246 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NefhP19246 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NefhP19246 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NefhP19246 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NefhP19246 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NefhP19246 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NefhP19246 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NefhP19246 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NefhP19246 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NefhP19246 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NefhP19246 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NefhP19246 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NefhP19246 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NefhP19246 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NefhP19246 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NefhP19246 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NefhP19246 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NefhP19246 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NefhP19246 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NefhP19246 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NefhP19246 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NefhP19246 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NefhP19246 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NefhP19246 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NefhP19246 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NefhP19246 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NefhP19246 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NefhP19246 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NefhP19246 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NefhP19246 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NefhP19246 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NefhP19246 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NefhP19246 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NefhP19246 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NefhP19246 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NefhP19246 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NefhP19246 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NefhP19246 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NefhP19246 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NefhP19246 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NefhP19246 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NefhP19246 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NefhP19246 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NefhP19246 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NefhP19246 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NefhP19246 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NefhP19246 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NefhP19246 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NefhP19246 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NefhP19246 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NefhP19246 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NefhP19246 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NefhP19246 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NefhP19246 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NefhP19246 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NefhP19246 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NefhP19246 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NefhP19246 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NefhP19246 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms