Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsdP18242 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsdP18242 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsdP18242 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsdP18242 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsdP18242 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtsdP18242 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsdP18242 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsdP18242 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsdP18242 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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