Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcnaP17918 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PcnaP17918 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnaP17918 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnaP17918 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnaP17918 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnaP17918 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnaP17918 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PcnaP17918 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms