Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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