Protein–RNA interactions for Protein: P16014

Chgb, Secretogranin-1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgbP16014 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ChgbP16014 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ChgbP16014 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ChgbP16014 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChgbP16014 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChgbP16014 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChgbP16014 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgbP16014 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgbP16014 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgbP16014 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgbP16014 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgbP16014 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgbP16014 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgbP16014 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgbP16014 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ChgbP16014 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms