Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim30aP15533 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms