Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lamp1P11438 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lamp1P11438 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms