Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Surf1P09925 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Surf1P09925 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Surf1P09925 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Surf1P09925 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Surf1P09925 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Surf1P09925 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Surf1P09925 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms