Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NefmP08553 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NefmP08553 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NefmP08553 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NefmP08553 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NefmP08553 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NefmP08553 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NefmP08553 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NefmP08553 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NefmP08553 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NefmP08553 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NefmP08553 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NefmP08553 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NefmP08553 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NefmP08553 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NefmP08553 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NefmP08553 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NefmP08553 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NefmP08553 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NefmP08553 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NefmP08553 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NefmP08553 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NefmP08553 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NefmP08553 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NefmP08553 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NefmP08553 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NefmP08553 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NefmP08553 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NefmP08553 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NefmP08553 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NefmP08553 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NefmP08553 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NefmP08553 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NefmP08553 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NefmP08553 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NefmP08553 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NefmP08553 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NefmP08553 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NefmP08553 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NefmP08553 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NefmP08553 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NefmP08553 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NefmP08553 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NefmP08553 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NefmP08553 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NefmP08553 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NefmP08553 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NefmP08553 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NefmP08553 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NefmP08553 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NefmP08553 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NefmP08553 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NefmP08553 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NefmP08553 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NefmP08553 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NefmP08553 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NefmP08553 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NefmP08553 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NefmP08553 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NefmP08553 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NefmP08553 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NefmP08553 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NefmP08553 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NefmP08553 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NefmP08553 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NefmP08553 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NefmP08553 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NefmP08553 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NefmP08553 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NefmP08553 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NefmP08553 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NefmP08553 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NefmP08553 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NefmP08553 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NefmP08553 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NefmP08553 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NefmP08553 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NefmP08553 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NefmP08553 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NefmP08553 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NefmP08553 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NefmP08553 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NefmP08553 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NefmP08553 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NefmP08553 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NefmP08553 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NefmP08553 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NefmP08553 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NefmP08553 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NefmP08553 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NefmP08553 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NefmP08553 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NefmP08553 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NefmP08553 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NefmP08553 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NefmP08553 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NefmP08553 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NefmP08553 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NefmP08553 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NefmP08553 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms