Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a2P08122 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a2P08122 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a2P08122 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a2P08122 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col4a2P08122 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a2P08122 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a2P08122 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a2P08122 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col4a2P08122 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Col4a2P08122 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col4a2P08122 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col4a2P08122 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col4a2P08122 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col4a2P08122 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col4a2P08122 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col4a2P08122 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Col4a2P08122 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Col4a2P08122 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms