Protein–RNA interactions for Protein: P06339

H2-T23, H-2 class I histocompatibility antigen, D-37 alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-T23P06339 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-T23P06339 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-T23P06339 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms