Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06321 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06321 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06321 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06321 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P06321 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P06321 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06321 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06321 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06321 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06321 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06321 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06321 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06321 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06321 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P06321 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06321 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P06321 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06321 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06321 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06321 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06321 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06321 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06321 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06321 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06321 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06321 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06321 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06321 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06321 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06321 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06321 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06321 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06321 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06321 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06321 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06321 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06321 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06321 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06321 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06321 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06321 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06321 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06321 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06321 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06321 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06321 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06321 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06321 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06321 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06321 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06321 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06321 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06321 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06321 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06321 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06321 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06321 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06321 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06321 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06321 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06321 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06321 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06321 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06321 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06321 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P06321 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06321 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06321 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06321 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06321 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06321 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06321 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06321 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06321 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06321 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06321 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06321 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06321 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06321 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06321 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06321 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P06321 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06321 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P06321 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06321 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P06321 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06321 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06321 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06321 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06321 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06321 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06321 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06321 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06321 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06321 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06321 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06321 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06321 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06321 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms