Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tk1P04184 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tk1P04184 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tk1P04184 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tk1P04184 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tk1P04184 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tk1P04184 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tk1P04184 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tk1P04184 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms