Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01735 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01735 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01735 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01735 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01735 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01735 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01735 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01735 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01735 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01735 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01735 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01735 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01735 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01735 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01735 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01735 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01735 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01735 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01735 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01735 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P01735 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01735 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01735 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01735 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01735 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01735 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01735 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01735 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01735 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01735 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01735 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01735 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01735 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01735 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01735 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01735 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01735 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01735 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01735 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01735 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01735 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01735 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01735 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01735 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01735 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01735 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01735 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01735 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01735 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01735 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01735 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01735 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01735 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01735 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01735 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01735 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01735 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01735 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01735 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01735 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01735 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01735 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01735 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01735 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01735 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
P01735 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01735 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01735 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01735 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01735 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01735 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01735 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01735 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01735 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01735 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
P01735 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01735 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01735 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01735 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01735 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01735 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01735 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01735 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01735 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01735 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01735 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01735 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01735 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01735 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01735 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01735 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01735 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01735 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01735 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01735 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01735 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01735 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01735 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P01735 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms