Protein–RNA interactions for Protein: P01656

Ig kappa chain V-III region MOPC 70, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01656 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01656 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01656 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01656 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01656 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01656 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01656 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01656 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01656 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01656 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01656 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01656 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01656 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01656 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01656 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01656 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01656 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01656 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01656 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01656 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01656 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01656 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01656 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01656 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01656 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01656 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01656 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01656 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01656 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01656 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01656 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01656 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01656 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01656 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01656 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01656 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01656 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01656 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01656 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01656 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01656 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01656 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01656 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01656 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01656 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01656 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01656 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01656 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01656 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01656 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01656 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01656 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01656 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01656 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01656 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01656 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01656 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01656 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01656 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01656 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01656 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01656 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01656 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01656 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01656 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01656 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01656 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01656 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01656 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01656 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01656 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01656 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01656 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01656 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01656 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01656 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01656 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01656 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01656 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01656 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01656 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01656 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01656 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01656 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01656 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01656 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01656 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01656 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01656 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01656 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01656 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01656 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01656 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01656 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01656 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01656 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01656 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01656 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01656 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01656 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms