Protein–RNA interactions for Protein: P01654

Ig kappa chain V-III region PC 2880/PC 1229, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01654 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01654 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01654 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01654 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01654 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01654 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01654 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01654 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01654 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01654 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01654 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01654 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01654 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01654 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01654 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01654 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01654 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01654 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01654 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01654 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01654 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01654 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01654 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01654 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01654 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01654 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01654 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01654 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01654 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01654 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01654 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01654 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01654 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01654 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01654 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01654 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01654 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01654 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01654 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01654 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01654 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01654 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01654 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01654 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01654 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01654 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01654 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01654 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01654 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01654 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01654 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01654 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01654 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01654 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01654 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01654 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01654 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01654 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01654 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01654 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01654 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01654 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01654 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01654 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01654 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01654 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01654 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01654 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01654 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01654 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01654 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01654 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01654 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01654 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01654 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01654 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01654 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01654 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01654 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01654 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01654 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01654 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01654 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01654 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01654 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01654 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01654 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01654 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01654 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01654 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01654 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01654 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01654 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01654 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01654 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01654 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01654 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01654 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01654 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01654 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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