Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01649 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01649 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01649 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01649 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01649 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01649 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P01649 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01649 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01649 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01649 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01649 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01649 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01649 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P01649 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01649 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01649 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P01649 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P01649 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01649 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P01649 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01649 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01649 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01649 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01649 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01649 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01649 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01649 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01649 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01649 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01649 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01649 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01649 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01649 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01649 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01649 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P01649 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01649 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01649 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01649 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01649 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01649 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01649 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01649 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01649 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01649 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01649 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01649 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01649 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01649 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01649 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01649 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01649 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01649 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01649 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01649 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01649 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01649 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01649 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01649 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01649 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01649 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P01649 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01649 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01649 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01649 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01649 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01649 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01649 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01649 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01649 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01649 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01649 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01649 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01649 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01649 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01649 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P01649 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01649 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01649 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01649 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01649 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01649 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01649 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01649 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01649 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01649 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01649 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P01649 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
P01649 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P01649 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P01649 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P01649 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P01649 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P01649 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
P01649 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
P01649 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
P01649 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01649 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P01649 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms