Protein–RNA interactions for Protein: P01635

Ig kappa chain V-V region K2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01635 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01635 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01635 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01635 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01635 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01635 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01635 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01635 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01635 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01635 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01635 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01635 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01635 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01635 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01635 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01635 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01635 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P01635 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01635 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01635 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01635 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01635 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01635 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01635 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01635 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01635 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01635 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01635 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01635 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01635 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01635 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P01635 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01635 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01635 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01635 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01635 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01635 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01635 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01635 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01635 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01635 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01635 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01635 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01635 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01635 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01635 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01635 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01635 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01635 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01635 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P01635 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P01635 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01635 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01635 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P01635 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01635 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01635 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01635 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01635 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
P01635 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01635 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01635 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
P01635 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01635 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01635 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01635 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01635 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
P01635 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01635 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01635 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01635 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
P01635 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01635 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01635 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01635 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01635 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01635 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01635 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01635 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01635 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01635 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01635 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01635 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01635 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01635 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01635 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01635 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01635 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01635 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01635 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01635 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01635 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01635 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01635 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01635 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01635 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01635 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
P01635 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01635 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01635 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms