Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tcn2O88968 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tcn2O88968 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms