Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MscO88940 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MscO88940 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MscO88940 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MscO88940 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MscO88940 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MscO88940 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MscO88940 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MscO88940 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MscO88940 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MscO88940 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MscO88940 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MscO88940 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MscO88940 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MscO88940 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MscO88940 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MscO88940 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MscO88940 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MscO88940 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MscO88940 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MscO88940 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MscO88940 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MscO88940 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MscO88940 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MscO88940 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MscO88940 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MscO88940 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MscO88940 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MscO88940 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MscO88940 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MscO88940 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MscO88940 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MscO88940 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MscO88940 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MscO88940 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MscO88940 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MscO88940 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MscO88940 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MscO88940 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MscO88940 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MscO88940 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MscO88940 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MscO88940 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MscO88940 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MscO88940 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MscO88940 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MscO88940 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MscO88940 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MscO88940 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MscO88940 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MscO88940 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MscO88940 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MscO88940 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MscO88940 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MscO88940 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MscO88940 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MscO88940 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MscO88940 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MscO88940 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MscO88940 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MscO88940 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MscO88940 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MscO88940 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MscO88940 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MscO88940 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MscO88940 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MscO88940 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MscO88940 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MscO88940 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MscO88940 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MscO88940 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MscO88940 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MscO88940 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MscO88940 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MscO88940 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MscO88940 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MscO88940 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MscO88940 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MscO88940 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MscO88940 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MscO88940 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MscO88940 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MscO88940 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MscO88940 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MscO88940 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MscO88940 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MscO88940 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MscO88940 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MscO88940 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MscO88940 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MscO88940 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MscO88940 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MscO88940 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MscO88940 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MscO88940 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MscO88940 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MscO88940 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MscO88940 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MscO88940 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MscO88940 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms