Protein–RNA interactions for Protein: O88870

Best1, Bestrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best1O88870 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Best1O88870 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Best1O88870 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Best1O88870 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Best1O88870 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Best1O88870 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Best1O88870 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Best1O88870 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Best1O88870 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Best1O88870 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Best1O88870 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Best1O88870 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Best1O88870 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Best1O88870 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Best1O88870 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Best1O88870 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Best1O88870 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Best1O88870 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Best1O88870 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Best1O88870 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Best1O88870 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Best1O88870 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Best1O88870 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Best1O88870 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Best1O88870 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Best1O88870 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Best1O88870 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Best1O88870 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Best1O88870 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Best1O88870 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Best1O88870 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Best1O88870 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Best1O88870 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Best1O88870 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Best1O88870 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Best1O88870 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Best1O88870 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Best1O88870 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Best1O88870 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Best1O88870 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Best1O88870 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Best1O88870 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Best1O88870 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Best1O88870 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Best1O88870 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Best1O88870 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Best1O88870 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Best1O88870 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Best1O88870 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Best1O88870 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Best1O88870 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Best1O88870 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Best1O88870 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Best1O88870 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Best1O88870 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Best1O88870 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Best1O88870 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Best1O88870 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Best1O88870 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Best1O88870 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Best1O88870 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Best1O88870 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Best1O88870 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Best1O88870 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Best1O88870 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Best1O88870 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Best1O88870 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Best1O88870 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Best1O88870 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Best1O88870 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Best1O88870 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Best1O88870 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Best1O88870 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Best1O88870 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Best1O88870 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Best1O88870 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Best1O88870 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Best1O88870 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Best1O88870 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Best1O88870 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Best1O88870 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Best1O88870 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Best1O88870 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Best1O88870 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Best1O88870 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Best1O88870 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Best1O88870 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Best1O88870 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Best1O88870 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Best1O88870 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Best1O88870 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Best1O88870 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Best1O88870 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Best1O88870 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Best1O88870 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Best1O88870 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Best1O88870 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Best1O88870 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Best1O88870 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Best1O88870 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms