Protein–RNA interactions for Protein: O88623

Usp2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp2O88623 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp2O88623 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp2O88623 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp2O88623 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp2O88623 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
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Usp2O88623 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp2O88623 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp2O88623 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp2O88623 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp2O88623 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp2O88623 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp2O88623 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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