Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfrO88507 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfrO88507 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfrO88507 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfrO88507 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfrO88507 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfrO88507 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntfrO88507 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CntfrO88507 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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