Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AvilO88398 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AvilO88398 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AvilO88398 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AvilO88398 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AvilO88398 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AvilO88398 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AvilO88398 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AvilO88398 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AvilO88398 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AvilO88398 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AvilO88398 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AvilO88398 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AvilO88398 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AvilO88398 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AvilO88398 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AvilO88398 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AvilO88398 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AvilO88398 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AvilO88398 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AvilO88398 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AvilO88398 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AvilO88398 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AvilO88398 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AvilO88398 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AvilO88398 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AvilO88398 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AvilO88398 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AvilO88398 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AvilO88398 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AvilO88398 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AvilO88398 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AvilO88398 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AvilO88398 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AvilO88398 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AvilO88398 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AvilO88398 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AvilO88398 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AvilO88398 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AvilO88398 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AvilO88398 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AvilO88398 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AvilO88398 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AvilO88398 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AvilO88398 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AvilO88398 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AvilO88398 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AvilO88398 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AvilO88398 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AvilO88398 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AvilO88398 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AvilO88398 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AvilO88398 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AvilO88398 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AvilO88398 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AvilO88398 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AvilO88398 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AvilO88398 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AvilO88398 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AvilO88398 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AvilO88398 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AvilO88398 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AvilO88398 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AvilO88398 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AvilO88398 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AvilO88398 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AvilO88398 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AvilO88398 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AvilO88398 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AvilO88398 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AvilO88398 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AvilO88398 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AvilO88398 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AvilO88398 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AvilO88398 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AvilO88398 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AvilO88398 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AvilO88398 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AvilO88398 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AvilO88398 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AvilO88398 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AvilO88398 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AvilO88398 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AvilO88398 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AvilO88398 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AvilO88398 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
AvilO88398 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AvilO88398 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AvilO88398 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AvilO88398 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AvilO88398 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AvilO88398 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AvilO88398 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AvilO88398 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AvilO88398 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AvilO88398 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AvilO88398 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AvilO88398 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AvilO88398 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AvilO88398 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms