Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CaskO70589 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CaskO70589 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CaskO70589 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CaskO70589 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CaskO70589 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CaskO70589 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CaskO70589 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CaskO70589 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CaskO70589 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CaskO70589 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CaskO70589 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CaskO70589 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CaskO70589 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CaskO70589 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CaskO70589 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CaskO70589 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CaskO70589 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CaskO70589 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CaskO70589 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CaskO70589 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CaskO70589 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CaskO70589 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CaskO70589 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CaskO70589 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CaskO70589 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CaskO70589 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CaskO70589 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CaskO70589 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CaskO70589 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CaskO70589 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CaskO70589 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CaskO70589 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CaskO70589 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CaskO70589 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CaskO70589 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CaskO70589 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CaskO70589 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CaskO70589 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CaskO70589 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CaskO70589 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CaskO70589 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CaskO70589 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CaskO70589 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CaskO70589 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CaskO70589 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CaskO70589 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CaskO70589 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CaskO70589 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CaskO70589 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CaskO70589 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CaskO70589 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CaskO70589 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CaskO70589 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CaskO70589 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CaskO70589 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CaskO70589 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CaskO70589 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CaskO70589 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CaskO70589 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CaskO70589 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CaskO70589 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CaskO70589 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CaskO70589 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CaskO70589 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CaskO70589 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CaskO70589 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CaskO70589 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CaskO70589 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CaskO70589 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CaskO70589 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CaskO70589 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CaskO70589 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CaskO70589 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CaskO70589 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CaskO70589 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CaskO70589 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CaskO70589 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CaskO70589 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CaskO70589 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CaskO70589 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CaskO70589 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CaskO70589 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
CaskO70589 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CaskO70589 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CaskO70589 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CaskO70589 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CaskO70589 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CaskO70589 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CaskO70589 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CaskO70589 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CaskO70589 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CaskO70589 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CaskO70589 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CaskO70589 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CaskO70589 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CaskO70589 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CaskO70589 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CaskO70589 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CaskO70589 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms