Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SfnO70456 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SfnO70456 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SfnO70456 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SfnO70456 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SfnO70456 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SfnO70456 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SfnO70456 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SfnO70456 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SfnO70456 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SfnO70456 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SfnO70456 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SfnO70456 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SfnO70456 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SfnO70456 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SfnO70456 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SfnO70456 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SfnO70456 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SfnO70456 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SfnO70456 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SfnO70456 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SfnO70456 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SfnO70456 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SfnO70456 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SfnO70456 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SfnO70456 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SfnO70456 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SfnO70456 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SfnO70456 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SfnO70456 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SfnO70456 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SfnO70456 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SfnO70456 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SfnO70456 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SfnO70456 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SfnO70456 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SfnO70456 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SfnO70456 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SfnO70456 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SfnO70456 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SfnO70456 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SfnO70456 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SfnO70456 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SfnO70456 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SfnO70456 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SfnO70456 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SfnO70456 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SfnO70456 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SfnO70456 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SfnO70456 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SfnO70456 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SfnO70456 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SfnO70456 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SfnO70456 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SfnO70456 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SfnO70456 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SfnO70456 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SfnO70456 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SfnO70456 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SfnO70456 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SfnO70456 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SfnO70456 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SfnO70456 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SfnO70456 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SfnO70456 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SfnO70456 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SfnO70456 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SfnO70456 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SfnO70456 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SfnO70456 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SfnO70456 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SfnO70456 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SfnO70456 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SfnO70456 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SfnO70456 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SfnO70456 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SfnO70456 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SfnO70456 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SfnO70456 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SfnO70456 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SfnO70456 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SfnO70456 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SfnO70456 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SfnO70456 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SfnO70456 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SfnO70456 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SfnO70456 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SfnO70456 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SfnO70456 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SfnO70456 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SfnO70456 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SfnO70456 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SfnO70456 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SfnO70456 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SfnO70456 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SfnO70456 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SfnO70456 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SfnO70456 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SfnO70456 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SfnO70456 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms