Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtssO70370 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtssO70370 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtssO70370 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtssO70370 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtssO70370 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtssO70370 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtssO70370 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtssO70370 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtssO70370 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtssO70370 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtssO70370 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CtssO70370 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtssO70370 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtssO70370 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtssO70370 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CtssO70370 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtssO70370 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtssO70370 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtssO70370 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtssO70370 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtssO70370 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtssO70370 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtssO70370 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtssO70370 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtssO70370 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtssO70370 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtssO70370 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtssO70370 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtssO70370 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtssO70370 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtssO70370 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtssO70370 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtssO70370 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtssO70370 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtssO70370 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtssO70370 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtssO70370 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms