Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cbx4O55187 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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