Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nipsnap2O55126 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nipsnap2O55126 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms