Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc3O55013 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc3O55013 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms