Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limk2O54785 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limk2O54785 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limk2O54785 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limk2O54785 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limk2O54785 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limk2O54785 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limk2O54785 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limk2O54785 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Limk2O54785 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Limk2O54785 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Limk2O54785 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limk2O54785 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limk2O54785 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limk2O54785 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limk2O54785 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limk2O54785 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limk2O54785 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limk2O54785 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limk2O54785 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Limk2O54785 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limk2O54785 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limk2O54785 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limk2O54785 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limk2O54785 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Limk2O54785 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limk2O54785 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limk2O54785 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limk2O54785 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limk2O54785 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limk2O54785 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limk2O54785 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limk2O54785 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Limk2O54785 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limk2O54785 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limk2O54785 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limk2O54785 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limk2O54785 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limk2O54785 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limk2O54785 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limk2O54785 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limk2O54785 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limk2O54785 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limk2O54785 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limk2O54785 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Limk2O54785 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limk2O54785 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limk2O54785 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Limk2O54785 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms