Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Sdc4O35988 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdc4O35988 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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