Protein–RNA interactions for Protein: O35900

Lsm2, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm2O35900 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lsm2O35900 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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