Protein–RNA interactions for Protein: O35604

Npc1, Niemann-Pick C1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npc1O35604 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npc1O35604 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npc1O35604 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Npc1O35604 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npc1O35604 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npc1O35604 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npc1O35604 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npc1O35604 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Npc1O35604 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npc1O35604 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Npc1O35604 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npc1O35604 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npc1O35604 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npc1O35604 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npc1O35604 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npc1O35604 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npc1O35604 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npc1O35604 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npc1O35604 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npc1O35604 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npc1O35604 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Npc1O35604 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npc1O35604 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npc1O35604 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npc1O35604 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npc1O35604 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npc1O35604 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npc1O35604 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npc1O35604 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npc1O35604 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npc1O35604 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npc1O35604 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npc1O35604 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npc1O35604 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npc1O35604 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npc1O35604 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npc1O35604 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npc1O35604 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npc1O35604 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npc1O35604 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms