Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edil3O35474 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edil3O35474 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Edil3O35474 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Edil3O35474 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edil3O35474 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edil3O35474 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Edil3O35474 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms