Protein–RNA interactions for Protein: O35448

Ppt2, Lysosomal thioesterase PPT2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppt2O35448 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppt2O35448 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppt2O35448 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppt2O35448 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppt2O35448 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppt2O35448 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppt2O35448 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppt2O35448 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppt2O35448 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppt2O35448 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppt2O35448 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppt2O35448 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppt2O35448 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppt2O35448 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppt2O35448 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppt2O35448 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppt2O35448 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppt2O35448 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppt2O35448 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppt2O35448 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppt2O35448 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppt2O35448 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppt2O35448 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppt2O35448 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppt2O35448 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppt2O35448 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppt2O35448 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppt2O35448 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppt2O35448 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppt2O35448 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppt2O35448 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppt2O35448 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppt2O35448 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppt2O35448 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppt2O35448 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ppt2O35448 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms