Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pkd2O35245 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pkd2O35245 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms