Protein–RNA interactions for Protein: O35216

Cenpa, Histone H3-like centromeric protein A, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpaO35216 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CenpaO35216 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CenpaO35216 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CenpaO35216 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CenpaO35216 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CenpaO35216 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CenpaO35216 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CenpaO35216 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
CenpaO35216 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CenpaO35216 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CenpaO35216 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CenpaO35216 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CenpaO35216 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CenpaO35216 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CenpaO35216 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CenpaO35216 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CenpaO35216 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CenpaO35216 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CenpaO35216 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CenpaO35216 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CenpaO35216 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CenpaO35216 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.06■□□□□ 0
CenpaO35216 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CenpaO35216 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CenpaO35216 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CenpaO35216 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CenpaO35216 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CenpaO35216 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CenpaO35216 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CenpaO35216 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CenpaO35216 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CenpaO35216 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CenpaO35216 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CenpaO35216 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CenpaO35216 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CenpaO35216 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CenpaO35216 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CenpaO35216 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CenpaO35216 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CenpaO35216 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CenpaO35216 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CenpaO35216 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CenpaO35216 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CenpaO35216 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CenpaO35216 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CenpaO35216 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CenpaO35216 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CenpaO35216 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CenpaO35216 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CenpaO35216 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CenpaO35216 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CenpaO35216 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CenpaO35216 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CenpaO35216 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CenpaO35216 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CenpaO35216 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CenpaO35216 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CenpaO35216 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
CenpaO35216 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CenpaO35216 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CenpaO35216 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CenpaO35216 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CenpaO35216 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CenpaO35216 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CenpaO35216 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CenpaO35216 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CenpaO35216 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CenpaO35216 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CenpaO35216 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CenpaO35216 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CenpaO35216 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CenpaO35216 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CenpaO35216 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CenpaO35216 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CenpaO35216 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CenpaO35216 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CenpaO35216 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CenpaO35216 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CenpaO35216 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CenpaO35216 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CenpaO35216 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CenpaO35216 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CenpaO35216 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CenpaO35216 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CenpaO35216 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CenpaO35216 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CenpaO35216 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CenpaO35216 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CenpaO35216 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CenpaO35216 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CenpaO35216 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CenpaO35216 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CenpaO35216 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CenpaO35216 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CenpaO35216 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CenpaO35216 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CenpaO35216 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CenpaO35216 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CenpaO35216 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CenpaO35216 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms