Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bhlhe40O35185 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms