Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NumblO08919 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NumblO08919 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NumblO08919 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NumblO08919 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NumblO08919 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NumblO08919 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NumblO08919 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NumblO08919 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NumblO08919 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NumblO08919 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumblO08919 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumblO08919 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumblO08919 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumblO08919 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumblO08919 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumblO08919 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumblO08919 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NumblO08919 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumblO08919 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumblO08919 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumblO08919 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumblO08919 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumblO08919 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumblO08919 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumblO08919 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumblO08919 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumblO08919 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumblO08919 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumblO08919 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumblO08919 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumblO08919 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumblO08919 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumblO08919 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumblO08919 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NumblO08919 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NumblO08919 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NumblO08919 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NumblO08919 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NumblO08919 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NumblO08919 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NumblO08919 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NumblO08919 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NumblO08919 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NumblO08919 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NumblO08919 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NumblO08919 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NumblO08919 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NumblO08919 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NumblO08919 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NumblO08919 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NumblO08919 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NumblO08919 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NumblO08919 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NumblO08919 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NumblO08919 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NumblO08919 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NumblO08919 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NumblO08919 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NumblO08919 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NumblO08919 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NumblO08919 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NumblO08919 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NumblO08919 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NumblO08919 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NumblO08919 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NumblO08919 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NumblO08919 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NumblO08919 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NumblO08919 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NumblO08919 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NumblO08919 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NumblO08919 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NumblO08919 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NumblO08919 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NumblO08919 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NumblO08919 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NumblO08919 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NumblO08919 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NumblO08919 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NumblO08919 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NumblO08919 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NumblO08919 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NumblO08919 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NumblO08919 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NumblO08919 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NumblO08919 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NumblO08919 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NumblO08919 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NumblO08919 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NumblO08919 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NumblO08919 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NumblO08919 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NumblO08919 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NumblO08919 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NumblO08919 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NumblO08919 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NumblO08919 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NumblO08919 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NumblO08919 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms