Protein–RNA interactions for Protein: O08688

Capn5, Calpain-5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn5O08688 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn5O08688 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn5O08688 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn5O08688 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Capn5O08688 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Capn5O08688 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Capn5O08688 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Capn5O08688 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn5O08688 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn5O08688 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn5O08688 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn5O08688 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn5O08688 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn5O08688 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn5O08688 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn5O08688 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn5O08688 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn5O08688 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn5O08688 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn5O08688 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn5O08688 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn5O08688 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn5O08688 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn5O08688 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn5O08688 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn5O08688 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn5O08688 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn5O08688 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn5O08688 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Capn5O08688 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms